一种以聚多巴胺为模板的复合纳米微球的制备方法，通过Fe3+诱导多巴胺快速聚合，得到粒径均一且可调的聚多巴胺纳米球，再以聚多巴胺为模板，将壳聚糖等生物高分子材料简单快速的包覆在聚多巴胺外侧，形成粒径均一且可调的可降解复合纳米微球。本发明通过聚合环境和参数的调控，可得到不同尺寸的聚合物复合纳米微球，简单快速且绿色环保，具有良好的应用潜力。利用该方法制备的复合纳米微球具有核壳结构，用于载药后，复合纳米微球的释药行为未出现突释和二次释放的现象，并表现出pH响应性，具有缓控制释放的特点。本发明所需原材料价廉易得，天然无毒，绿色环保且生物可降解，拓展了以聚多巴胺为模板的生物高分子纳米材料的制备和应用。