本发明实施例提供了一种分级应用拓扑生成方法、系统及集群，其中，该方法，包括：当应用中的实例发生调用时，通过实例配置的探针在后端调用对应的类方法处记录后端调用数据；其中，后端调用数据包括调用关系数据、调用评价指标数据以及实例对应的应用标识、服务标识、集群标识和探针标识；通过探针将后端调用数据上报给数据处理服务器，并通过数据处理服务器基于实例对应的应用标识、服务标识、集群标识得到后调调用数据的聚合数据，以及将聚合数据以及后端调用数据存储到数据库；通过业务分析系统查询后端调用数据以及聚合数据，并基于后端调用数据以及聚合数据生成分级应用拓扑，可以简化应用拓扑，便于逐级对查看信息进行定位，提高查看效率。