本发明涉及于生物抗菌水凝胶材料领域，特别是指一种可注射型天然三萜化合物抗菌水凝胶及其制备方法。本发明公开的水凝胶甘草酸和五环三萜化合物或四环三萜化合物的混合物为凝胶分子，以磷酸缓冲盐溶液(PBS)为凝胶溶剂，利用了混合物之间形成的非共价键作用力，通过小分子自组装机制制备而得，制备的水凝胶不需要添加抗菌药物即可表现抗菌性，而且显著提高了水凝胶的机械特性。本发明水凝胶的制备方法简单，不仅可以简化可注射抗菌水凝胶的制备过程，而且扩大了三萜类化合物的应用领域。使其能够制成具有生物医学应用特性的且具有机械强度可注射的新型抗菌材料。