本发明涉及一种应用于诊断载玻片的超疏水涂料及其制备方法，本发明将质量分数为38～48％的四氟乙烯和六氟丙烯的共聚物、质量分数为0.5～2％的热固性丙烯酸树脂、质量分数为0.03～0.08％的己二酸二酰肼、质量分数为0.2～0.6％的活性稀释剂、质量分数为0.3～0.7％的增稠剂和质量分数为0.05～0.15％的消泡剂按照比例混合均匀，然后用分散剂于2000～2500r/min下分散30～60min，然后再将混合涂料于超声波分散40～60min，然后将分散好的涂料于60～80℃下水浴加热30～60min得混合物料，按照比例加入质量分数为0.5～2％的纳米二氧化硅、质量分数为1～3％的硅烷偶联剂，采用三辊机研磨10遍得到超疏水涂料，本发明的超疏水涂料制备工艺简单，易操作，且本发明的涂料能经受酶和微波的处理，本发明的涂料具有储存时间长、耐酸与玻璃附着力好等优点。