本发明公开一种功角实时确定方法及系统，该方法包括：获取母线M的第一电压和第一电流以及母线N的第二电压和第二电流，根据第一电压和第一电流确定系统母线M侧的电势，根据第二电压和第二电流确定系统母线N侧的电势，根据第一电压确定电压最低点的电压，记为第三电压，判断第一电势幅值和第二电势幅值的大小，得判断结果；若判断结果表示第一电势幅值大于或等于第二电势幅值，采用第一功角公式确定功角大小，若判断结果表示第一电势幅值小于第二电势幅值，采用第二功角公式确定功角大小。通过本发明上述方法在等效双电源系统两侧电势不相等的情况下，采用不同状况下的功角计算公式，确定功角，提高功角的精确度。