本发明公开了一种非并网风电电解水制氢系统及其协同控制方法，所述系统包括：风力发电机组，准Z源变流装置、直流母线、制氢装置和控制单元；风力发电机组中每个风力发电机通过一个对应的准Z源变流装置与直流母线连接；制氢装置与直流母线连接，制氢装置包括n个并联支路，每个并联支路上有m个串联的制氢单元，每个制氢单元包括多个电解槽，每个并联支路上串联有一个支路开关，每个制氢单元并联有一个功率开关。控制单元用于监控风力发电机组的运行状态、调整直流母线的电压等级、控制支路开关和功率开关的启闭。本发明的非并网风电电解水制氢系统及其协同控制方法，可以保证制氢过程中源端和荷端的适配性，提高制氢效率，降低生产成本。