本发明提供一种防止核电站给水泵汽蚀的方法及系统，包括：步骤S1、生成预设蒸汽凝结水流量曲线组，并建立核电站管道设备模型；根据所述核电站管道设备模型和预设蒸汽凝结水流量曲线组计算获得给水泵有效汽蚀余量及除氧器水位，根据所述给水泵有效汽蚀余量及除氧器水位对所述预设蒸汽凝结水流量曲线组进行修正，生成修正蒸汽凝结水流量曲线组；步骤S2、根据所述修正蒸汽凝结水流量曲线组控制调节阀组件向所述除氧器提供蒸汽和凝结水，并将经所述除氧器处理后的凝结水输送至所述给水泵以防止给水泵汽蚀。本发明可有效防止给水泵汽蚀。