本发明涉及塑料改性加工技术领域，尤其是一种聚碳酸酯及其合金改性专用阻燃增效功能母粒及其制备方法；功能母粒以多重复合包覆的四溴双酚A碳酸酯齐聚物为主体阻燃剂，其质量百分比组成如下：多重复合包覆四溴双酚A碳酸酯齐聚物55.0～70.0 wt.%、柠檬酸钠15.0～30.0 wt.%、乙烯–丙烯酸缩水甘油酯共聚物10.0～14.0 wt.%、脂肪族共聚酯0.0～4.0 wt.%、超支化聚酯0.0～0.5 wt.%、分散剂0.5～1.0 wt.%、润滑剂0.3～0.5 wt.%；本发明的阻燃增效功能母粒与传统塑料阻燃功能母粒相比，提高了上述三种国产溴系阻燃剂的热稳定性和流动分散性，从而提升阻燃效率，能够以更少的母粒添加量取得与传统阻燃功能母粒相同的阻燃效果，并可有效降低改性聚碳酸酯及其合金的阻燃复合物的力学性能损失。