本公开是关于一种基于扰动观测器的BUCK变流器并联动态补偿方法以及系统。其中，方法包括：采集多BUCK变流器并联的公共负载端的总扰动信号；根据各BUCK变流器的剩余容量，将总扰动信号分解为各BUCK变流器对应的分扰动信号；将各BUCK变流器的分扰动信号通过各BUCK变流器的并联动态补偿结构生成补偿信号；BUCK变流器电流环补偿结构根据补偿信号抵消电流环的反馈影响，以完成BUCK变流器并联动态补偿。本公开可有效提高响应速度，减少了负载切入切出对电网的冲击，保证直流母线电压的稳定。