本发明提供一种海上小型堆重要系统的辅助供电方法及装置，所述方法包括当触发第一母线失压信号时，同时触发辅助电源、应急电源和波浪能发电装置的启动信号；当监测到辅助电源和应急电源分别在预设第一时间段和预设第二时间段均不能启动时，触发波浪能发电装置带载信号，预设第二时间段开始时刻从预设第一时间段结束时刻开始计算；闭合设置在波浪能发电装置和电力电子变换装置之间的第一断路器，形成波浪能发电装置与第二母线之间的供电电路；波浪能发电装置通过供电电路向第二母线输送经电力电子变换装置调节后的电力。通过本发明，在海上小型堆断电时，使用波浪能发电装置供电，解决现有后备电源共模故障以及柴油发电机占用空间大的问题。