本发明涉及一种提高生物降解脂肪族芳香族共聚酯结晶性能的方法，主要解决现有技术中生物降解脂肪族芳香族共聚酯结晶温度低，结晶速度慢的技术问题。通过采用包括以下步骤：在反应器中加入原料、催化剂及支化剂等助剂，经酯化和缩聚得到脂肪族芳香族共聚酯熔体；将得到的脂肪族芳香族共聚酯熔体，直接经剪切、冷却，或者将得到的脂肪族芳香族共聚酯熔体冷却造粒后，再经熔融、剪切、冷却，得到高结晶性能的脂肪族芳香族共聚酯；其中，所述剪切为最大持续剪切速率不低于50s‑1，最大持续剪切速率与持续剪切时间的乘积不低于10的技术方案，较好地解决了该问题，可应用在高结晶温度生物降解脂肪族芳香族共聚酯材料生产中。