本发明公开了一种单纵模与非单纵模双脉冲激光交替调Q输出方法及激光器，该激光器包括：激光输出镜、电光调Q晶体、起偏器、45°反射镜、第一激光增益介质、第一激光全反射镜、第一耦合透镜组、第一光纤、第一泵浦源、四分之一波片、第二激光增益介质、第二激光全反射镜、第二耦合透镜组、第二光纤和第二泵浦源，当电光调Q晶体迅速加压时，所述激光器输出非单纵模激光，当电光调Q晶体阶跃式退压时，所述激光器输出单纵模激光。本发明不仅能够输出双脉冲激光，而且所输出的脉冲序列从时间上来看为单纵模与非单纵模交替输出的。