Invention Publication
- Patent Title: 基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法
- Patent Title (English): ErbB targeted protein family-oriented scoring function construction method based on graph convolution
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Application No.: CN201911064826.3Application Date: 2019-11-04
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Publication No.: CN110767266APublication Date: 2020-02-07
- Inventor: 杨帅 , 王卓亚 , 王小红 , 赵志刚 , 窦方坤 , 曹皓伟 , 魏志强 , 刘昊 , 杨金波
- Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心) , 青岛海洋科学与技术国家实验室发展中心
- Applicant Address: 山东省济南市历下区科院路19号山东省计算中心
- Assignee: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心),青岛海洋科学与技术国家实验室发展中心
- Current Assignee: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心),青岛海洋科技中心
- Current Assignee Address: 山东省济南市历下区科院路19号山东省计算中心
- Agency: 北京华际知识产权代理有限公司
- Agent 褚庆森
- Main IPC: G16B40/00
- IPC: G16B40/00 ; G16B15/30

Abstract:
本发明的基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法,包括:a).构建ErbB靶向蛋白数据,对于ErbB包含的4个受体酪氨酸激酶ErbB-1、ErbB-2、ErbB-3和ErbB-4均构建靶向蛋白数据集;b).扩大数据集规模,采用原始构象、旋转构象、优化构象的方法扩大数据集规模;c).构建ErbB靶向蛋白家族机器学习打分函数模型;d).模型的训练和评估。本发明的打分函数构建方法,建了一个ErbB蛋白家族机器学习分子亲和力评估数据集,为ErbB蛋白家族的机器学习任务奠定了数据基础;通过GCN技术突破了经典打分函数的瓶颈,提高了打分函数的性能,解决了机器学习打分函数通用模型准确率低的问题。
Public/Granted literature
- CN110767266B 基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法 Public/Granted day:2023-04-18
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