基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法
Abstract:
本发明的基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法,包括:a).构建ErbB靶向蛋白数据,对于ErbB包含的4个受体酪氨酸激酶ErbB-1、ErbB-2、ErbB-3和ErbB-4均构建靶向蛋白数据集;b).扩大数据集规模,采用原始构象、旋转构象、优化构象的方法扩大数据集规模;c).构建ErbB靶向蛋白家族机器学习打分函数模型;d).模型的训练和评估。本发明的打分函数构建方法,建了一个ErbB蛋白家族机器学习分子亲和力评估数据集,为ErbB蛋白家族的机器学习任务奠定了数据基础;通过GCN技术突破了经典打分函数的瓶颈,提高了打分函数的性能,解决了机器学习打分函数通用模型准确率低的问题。
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