本发明涉及一种智能变电站SDN网络的时间同步方法及系统，方法包括：SDN控制器通过SDN控制器对时接口获取时钟源提供的当前时钟，并对SDN交换机进行授时，SDN控制器基于所述当前时钟进行流表下发，SDN交换机通过SDN交换机对时接口获取所述当前时钟，并对测控装置进行授时。本发明提供一种智能变电站SDN网络的时间同步方法与系统，本发明把SDN控制器引入智能变电站中，替代传统的以太网交换机组网方式，能够进行网络协议集中处理，有利于提高复杂协议的运算效率和收敛速度，可解决变电站中的环网自愈问题。