本发明实施例公开了一种含吡唑醚菌酯和代森联的杀菌组合物及其制备方法，所述杀菌组合物包括以下质量百分含量的原料：吡唑醚菌酯3～8％、代森联50～60％、分散剂10～30％、润湿剂1～5％、pH值调节剂0.5～3％、助崩剂0.5～5％、消泡剂0.05～0.3％、填料0～20％。制备杀菌组合物的方法包括：按照比例将所述分散剂、润湿剂、pH值调节剂、助崩剂溶于水中形成混合溶液；在混合液中继续加入吡唑醚菌酯、代森联和填料均质分散形成混合浆料。本发明实施例的杀菌组合物包括吡唑醚菌酯和代森联这两种具有不同杀菌机理的有效成分，兼有保护和治疗作用，可有效防治担子菌、子囊菌等真菌引起的病害，并且对非靶标生物和环境更安全。