本发明实施例公开了一种双能CT图像去噪方法、装置、终端及存储介质，其中该方法包括：根据双能CT图像确定第一基物质图像和第二基物质图像；根据所述第一基物质图像和所述第二基物质图像，确定引导图像和待滤波图像；利用所述引导图像对所述待滤波图像进行引导滤波，得到滤波图像，并根据所述待滤波图像与所述滤波图像确定噪声图像；根据所述噪声图像对第一基物质图像和第二基物质图像进行去噪。本发明实施例提供的一种双能CT图像去噪方法、装置、终端及存储介质，用于提高双能CT图像的去噪效果。