本发明公开了融合海流能发电的海岛微网系统，包括微网控制中心站的站内快速控制系统和站外较长时间尺度控制系统，站内快速控制系统的中央控制器、模式切换控制器和站内间隔微电网智能终端均与过程层交换机通过光纤相连，对时服务器控制中央控制器、模式切换控制器和站内间隔微电网智能终端保持快速同步；站外较长时间尺度控制系统包括能量管理系统和站外海流能发电装置，能连管理系统和站外海流能发电装置通过工业级交换机相连，站内快速控制系统中的中央控制器、模式切换控制器和站内间隔微电网智能终端也均与较长时间尺度控制系统的工业级站外交换机相连。本发明的优点是：保证了海岛微电网系统的可靠、稳定运行。