本发明公开了用于花生品种鉴定的SNP芯片，所述SNP芯片包含725个SNP分子标记，所述SNP分子标记的编号分别为SNP001～SNP725，核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：725所示。本发明同样提供了该SNP芯片的设计及制备方法，即该芯片所包含的SNP标记是通过分析花生栽培种重测序数据，检测SNP变异；对SNP标记进行筛选；再进行设计探针制作SNP芯片。本发明还提供了该SNP芯片在花生品种鉴定中的应用。本发明设计的725个SNP标记将为花生栽培种品种鉴定提供分子技术手段，进一步提升我国花生品种鉴定水平。