本发明提供了一种复杂矿体的联合充填采矿方法。所述联合充填采矿方法采用上向水平分层进路充填法与分段分条充填法联合的采矿方法，将采场沿矿体走向布置，由三个分段组成，将每个分段划分为四个水平分层，且按自下而上分层顺序进行开采，在每个分层内划分盘区和进路。采用回采矿柱-回采矿房交替式回采的方式依次进行回采，各进路回采完毕后用优化配比的尾砂胶结充填料进行充填。本发明提供的尾砂胶结充填体抗压强度大，采场充填工艺稳固安全。本发明提供的联合充填采矿方法，具备适应矿体形态变化的能力强灵活性大、生产能力大、生产成本低、回采安全可靠、采矿损失贫化低、采矿作业环境好的优点。