本发明提供了一种正六棱截面轴类偏心测量方法，通过利用平折挺杆式检测机构可准确便捷地对正六棱截面轴类进行偏心测量。将平折挺杆式检测机构的一端紧靠六方轴，且位于六方轴待测截面下方，同时将位移传感器置于检测机构另一端下方；转动六方轴，检测机构随六方轴绕其回转中心摆动，位移传感器实时记录检测机构的摆动位移值；根据各部分几何关系与数学变换推导出预测的偏心量和偏转角与已知参数及位移传感器示值之间的函数关系式。本发明的测量方法简单便捷，测量精度高，为六方轴直线度测量与六方轴校直等工程问题提供了有效的解决方案。