本发明公开一种柔性CdTe薄膜太阳能电池的制备方法，包括以下步骤：取柔性基底，采用离子束溅射工艺清洁柔性基底；在柔性基底上依次制备下阻隔层、微结构层、透明导电层、上阻隔层、缓冲层、吸收层、背接触层与保护层；下阻隔层为TiO2、ZnO、Al2O3、SnO或In2O3薄膜；微结构层为为单分散SiO2小球薄膜；透明导电层为BZO、AZO、GZO、IGZO或ITO薄膜；上阻隔层为TiO2、ZnO、Al2O3、SnO或In2O3薄膜；最终得到柔性CdTe薄膜太阳能电池；本方法制备得到的薄膜太阳能电池能够提高对太阳能的吸收率，增强薄膜太阳能电池的整体性能。