本发明涉及一种基于医院互联网的无人取药系统，包括：第一电脑终端，用于接收加密电子药单，对加密电子药单进行解密发送出药指令，药房终端根据出药指令将药品送至传送带；药品扫描装置，对传送带上的药品进行扫描，将扫描后的药品信息发送至第一电脑终端，第一电脑终端根据药单编码、病人的信息和扫描后药品信息生成药品扫描清单，将药品扫描清单打印成纸质药品清单；药单采集装置，对纸质药品清单进行采集得到第一药品清单，对病人持有的纸质药单进行采集得到第二药品清单；与医院网络隔离的第二电脑终端采用相似度算法确定第一药品清单和第二药品清单的相似度，根据相似度判断是否出药。通过本发明的上述系统能够提高病人取药时药品的安全性。