本发明公开一种隧道沉管运输安装工程船的推进电控系统及电控方法，所述工程船为双船体型工程船，其艉侧具有主推进器，包括设于所述双船体型工程船上的中央控制器，与其相互连接的配电板、若干个驱动电机；所述双船体型工程船上设有主机，用以驱动所述主推进器，所述主机上还连有两组轴带发电机，每组轴带发电机均通过所述配电板连接一个所述驱动电机；每个所述驱动电机上均连有两台交叉连接控制的侧推进器，其中一台所述侧推进器设于所述双船体型工程船的艏侧位置，另一台所述侧推进器设于所述双船体型工程船的艉侧位置。本发明提高工程船在作业时的稳定性和精准性。