本发明公开了一种砂石料仓库自动化环保堆料系统，包括：料仓，其设置有多个隔仓；称重单元，其用于称量待入库的砂石料重量；料斗，其设置在卸车房内；第一喷雾除尘装置，其设置在所述卸车房内，并且位于所述料斗的上方；第二喷雾除尘装置，其设置在所述料仓内,并且位于所述隔仓上方；输送机，其设置在所述料斗与所述料仓之间，用于将料斗中的砂石料输送至所述料仓处；堆料机，其能够将所述输送机上的石料卸入所述隔仓中。同时本发明还提供了一种砂石料仓库自动化环保堆料系统的控制方法。