本发明公开了一种防腐涂层及其制备方法和应用，其由甲乙两种组分按照质量份配比为1:4混合而成，所述甲组分由以下质量份配比的原料混合制备而成：多异氰酸酯预聚体15～25份，消泡剂0.05～0.1份，丙二醇二醋酸酯5～15份；所述乙组分由以下质量份配比的原料混合制备而成：水性树脂A 25～35份，水性树脂B 25～35份，去离子水5～10份，消泡剂0.2～2份，流平剂0.1～2份，分散剂0.2～2份，针状氧化锌30～40份，流变剂0.1～0.5份，高熵合金粉末20～30份。本发明通过在涂层中添加针状氧化锌和单一体心立方结构的纳米高熵合金颗粒，提高了涂层的硬度和耐腐蚀性。使用本发明喷涂于隔音垫或船舶时，腐蚀速率明显降低，抗菌性能增强，使得隔音垫或船舶具有较长的使用寿命。