本申请提供了一种冷却系统及医疗设备。所述冷却系统包括：第一级冷却装置、动力装置、第二级冷却装置、第一温度检测装置、加热装置、第二温度检测装置和控制器。动力装置连通于第一级冷却装置和第二级冷却装置之间。第一温度检测装置设置于动力装置的输出端，用于检测动力装置输出的第三冷却剂温度，得到第一温度。加热装置连通于第二级冷却装置和第一级冷却装置之间。第二温度检测装置设置于加热装置的输出端，用于检测加热装置输出的第三冷却剂温度，得到第二温度。控制器用于根据第一温度确定是否调节第一级冷却装置。控制器还用于根据第一温度或第二温度确定是否开启第二级冷却装置或加热装置，以调节加热装置输出的第三冷却剂的温度。