一种电磁能海水淡化装置，涉及海水淡化与节能减排领域，电磁能海水淡化装置包含毛细介质和冷凝装置；毛细介质与海水连通，且其表层设置纳米磁基材料；纳米磁基材料置于交变磁场中，并切割交变磁场产生热量，热量作用于纳米磁基材料孔隙之间的海水产生蒸汽，蒸汽通过冷凝装置冷凝成淡水。本发明还公开了一种基于上述电磁能海水淡化装置的海水淡化方法。本发明通过电磁生热技术实现对薄层海水的急速加温，避免了显热损失，提高了海水淡化过程中的能量转化率。