本发明公开了一种高纯度抑菌灵及其衍生物的合成方法，包括以下具体步骤：将伯胺或仲胺加入溶剂中，再加入全氯甲硫醇，并于室温反应14～18小时，反应液经水洗、分液、干燥、浓缩溶剂后分离制得中间体1；将中间体1和溶剂、氟化物混合，加热至100～140℃反应6～18小时，反应液经过滤、水洗、干燥、浓缩溶剂、精馏后分离制得中间体2；将中间体2和溶剂混合，在0～10℃下通入氯化氢气体反应2～16小时，反应液经水洗、分液、干燥、浓缩溶剂后制得中间体3；将中间体4和溶剂混合，在0～10℃下加入碱，反应0.5～1小时后加入中间体3，并于室温反应1～2小时，反应液经水洗、分液、干燥、浓缩溶剂后得到目标化合物。本发明成本低、产品收率较高且可以得到高纯度产品。