本发明提供了一种土压平衡盾构长距离下穿河流施工方法，包括以下步骤：S1)在盾构机掘进至距离入河段河流与河岸交界位置调整盾构机掘进的土仓压力设定值；S2)待盾构机继续掘进穿过入河段河流与河岸交界位置，对入河段河岸与河流交界位置处的对应管片进行二次注浆操作形成止水环箍；S3)在盾构机继续在河流底部掘进的同时，通过控制盾构机的掘进姿态、掘进参数和调整同步注浆方法，控制盾构管片的上浮量在设计范围内；在盾构机掘进至与出河段河流与河岸交界位置相距第一预定距离时，调整盾构机掘进的土仓压力设定值；S4)待盾构机继续掘进穿过出河段河流与河岸交界位置至盾构机的盾尾进入河岸区域，对对应管片进行二次注浆操作形成止环箍。