本发明公开了一种光伏电站故障综合预警系统，该系统以光伏电站为对象，对光伏电站进行故障预警。首先对光伏电站的现场设备和环境参数进行采集，通过监控模块、数据传输及处理模块进行光伏电站健康度测算。根据历史故障信息模块及决定故障检测顺序模块，得到各个部件的故障率，并根据部件故障率的高低决定故障检测的顺序，最终实现故障预警。本发明可以多方面考虑了触发故障预警系统，在光伏电站综合健康度低于临界值时以及单个部件数据异常时都会进行故障预警，从而保障了光伏发电系统的安全运行，降低光伏电站的经济损失。