本发明公开了一种变压器短路故障定位检测方法及系统，用于解决对变压器故障的检测存在着无法对短路故障位置进行定位的技术问题。本发明包括以下步骤：使用变压器绕组变形故障定位检测系统检测正常变压器以及待测变压器，测得正常变压器以及待测变压器的扫频阻抗曲线，将两者的扫频阻抗曲线相比较，根据比较结果判别待测变压器是否发生短路故障并计算分析绕组发生短路故障的位置区域。本发明通过建立变压器短路故障定位检测系统与变压器进行连接，通过获取变压器的扫频阻抗曲线从而对变压器短路故障进行位置定位，解决了现有技术无法对变压器短路故障的位置进行定位的不足，对预防电网事故具有重要的意义。