本发明公开了一种基于PCIE接口高速传输方法、存储介质及终端，所述方法包括：判断FPGA原型验证开发板中功能库是否存在，在确定功能库存在之后对所述功能库进行初始化；调用设备查找打开接口，枚举当前终端中所有的PCIe设备，并打开设备CAPI；对指定地址进行寄存器读写，之后根据读写结果判断数据比对是否正确，如果正确，则对指定地址进行DMA传输，并对数据进行对比和处理，之后关闭设备CAPI；如果判断数据比对结果为错误时，则直接关闭设备CAPI，停止传输，能够高速的在主机和原型之间传输大量数据，接近实时测试并可以以硬件速度执行用户设计，加速了设计验证，并增加了FPGA原型验证的测试覆盖面，能有效的解决背景技术提出的问题。