本发明提供一种主被动兼容水声定位系统，包括4个潜标组网设备和1个潜标定位终端；所述潜标组网设备与潜标定位终端均包括潜标、电池组，所述潜标与电池组固定连接；所述潜标包括电子舱以及分别位于电子舱两端的收发合置水声换能器和深度计，收发合置水声换能器配置为发送与接收7～11kHz水声信号，深度计配置为获取潜标的深度信息；所述潜标组网设备还包括浮标。本发明在一套系统中同时满足水下目标自主发声时的主动定位需求和隐蔽不发声时的被动定位需求，采用多种通信方式，能满足系统跟岸基系统的连通性、经济性等多种需求，部署在近海时，可采用经济的无线通信方式与岸基进行通信；部署在中远海时，可采用卫星通信方式与岸基进行通信。