本发明属于扩频通信技术领域，公开了一种低SNR高动态环境下的输出峰值位同步处理方法，包括帧存在检测和位同步两个过程。帧存在检测采用二次FFT累加方式，以非扩频码长度整数倍的间隔向后滑动做FFT；再设置一判决门限进行捕获判决，若FFT输出的最大值大于门限，则捕获成功。位同步采用滑窗找最大峰值方法，即在捕获位置前后两个相位点处开始间隔滑动做FFT，每次滑动做1个FFT，再求出这4次FFT输出峰值的最大值及其对应位置，由此确定位同步位置。本发明采用优化后的二次FFT累加技术实现的同步方法不仅能适应低SNR高动态环境，还大大降低了运算复杂度。