本发明公开了一种镍基高温合金脱硫的方法，该方法包括：精选冶炼原材料；采用ZG-0.025型真空感应熔炼炉熔炼Inconel690合金铸锭，其工艺参数为：抽真空至0.01Pa，10～15kW：10～20min；20～25kW直到熔化；真空度≤0.1Pa，精炼20min，电磁搅拌；高真空下充入高纯氩气，调整温度，加入元素铝、硅、钛、铌和钼及易挥发元素锰进行微合金化和脱氧，电磁搅拌；降低功率，浇注，冷却取出铸锭，切除冒口。本发明得到的镍基高温合金内部组织致密、化学成分均匀、无缩孔和缩松，铸锭硫含量≤5ppm。