本发明提供了一种通过交流侧功率控制实现模块化多电平电池储能系统电池混用的方法，所述方法包括如下步骤：第一步：获取模块化多电平储能系统各个子模块电池电压、SOC、SOH、SOF、额定容量信息；第二步：计算各个子模块的可充电能量和可放电能量；第三步：计算各相和整个系统总的可充电电量和可放电电量；第四步：各相充放电功率的预分配；第五步：子模块功率的预分配；第六步：子模块功率的校核；第七步：子模块功率和三相功率的再分配；第八步：零序电压注入实现三相间均衡；第九步：子模块交流电压的分配。本发明以实现模块化多电平储能系统中的不同的电池混用为目标，同时考虑到安全运行边界，可以更加充分地利用不同类型电池的资源。