本发明公开了一种基于地下水模型的坎儿井数值模拟方法，涉及水文水资源技术领域，其将坎儿井段分为暗渠、明渠和漫流区三个部分，每个部分均输入对应的坎儿井模拟参数；根据坎儿井模拟参数建立坎儿井概念模型；根据坎儿井概念模型，采用有限差分矩阵方程对坎儿井与地下水动态关系进行模拟，通过水量平衡方程对收敛的模拟结果水头值进行水均衡检验计算，最终输出所有时段的水均衡误差、坎儿井概念模型中的参数值以及收敛后的水头值，完成坎儿井数值模拟。该方法能够实现对坎儿井水流从集水到蓄水全过程的系统性模拟，提供了在农业季节性需水要求下的坎儿井水量分析途径，建立了分析坎儿井农业用水量和生态用水量之间关系的模型。