本发明公开了一种抽水蓄能电站辅机系统自动控制方法，辅机控制系统在自动控制模式下控制辅机设备的启动和切换；所述自动控制模式包括优化运行模式，在所述优化运行模式下，辅机控制系统根据各个辅机设备的健康状态控制选择辅机设备的启动工作。本发明的优点在于：在自动控制模式下设置优化运行方式，可以根据各个辅机设备的健康状态来控制辅机设备的运行，以使得各辅机设备均能安全可靠的运行，防止某一设备的长时间运行造成的健康损伤，从而避免其寿命的降低或出现故障的机率；同时自动控制方法安全可靠科学合理，并可以降低电站运维工作强度，提高工作效率，减少运维成本。