本发明公开了一种基于智能配电网的自愈控制系统及其操作方法，包括人机交互界面、线路自愈系统、配电网路、线路检测系统和故障报警单元，所述线路自愈系统与配电网路实现双向连接，本发明涉及自愈控制系统技术领域。该基于智能配电网的自愈控制系统及其操作方法，通过设置线路检测系统来检测电路，在出现故障时可启动线路自愈系统，线路自愈系统中的线路预估与分析系统可按照故障的严重性智能分析出处理方案，并利用多线路转移系统将正常电路的部分电流分配到备用电路中，而利用风险评估系统可判断正常电路和备用电路在分配好电流后各自电路的安全性，合理的调整分配比例，尽量在不影响使用的情况下避免再次出现电路故障。