本发明公开了抑制LYN激酶引起的MLCK激活的融合多肽及其应用。本发明提供了一种融合多肽，由MLCK蛋白的第456‑471位氨基酸与穿膜肽连接而成。所述穿膜肽由9个精氨酸残基组成；所述MLCK蛋白的第456‑471位氨基酸的序列如SEQ ID No.1的第11‑26位所示。本发明根据首次发现的LYN激酶与MLCK相互作用的分子机制设计了具有抑制LYN激酶引起的MLCK激活的融合多肽，经实验证明，该融合多肽细胞水平抑制MLCK激活的功能，并可以抑制肿瘤细胞迁移的能力，具有作为临床药物的巨大潜力。