一种电力系统合并单元测试误差的方法和系统，设置有标准模拟源、测试单元和合并单元，标准模拟源负责输出交流电压和电流模拟量信号，测试单元负责模拟量的采集、SV数字量的输出、模拟量和数字量之间的幅值误差和相位误差的设定，合并单元负责采集标准模拟源输出的模拟量和测试单元输出的SV数字量，并计算标准模拟源输出的模拟量和测试单元输出的SV数字量之间的幅值误差和相位误差。该发明可用于电力系统合并单元测试仪测量误差的测试，填补了国内对于电力系统合并单元测试误差领域的空白，简化测试环境，降低人力和设备成本，提高合并单元测试误差的效率。