本发明公开了一种基于E1的精密时钟同步技术，在传统的只有频率同步的E1链路上实现PTP-E1协议，从而实现了在E1链路上对相位偏差的测量，实现主从系统的时间同步。该技术包括E1模块、PTP-E1协议模块、用户接口模块、CPU模块、本地时钟模块、系统频率相位调整模块、本地时钟信号产生模块，所述E1模块实现E1的编解码，所述PTP-E1协议模块实现主从授时协议，所述CPU模块实现系统配置及主从偏差计算，所述本地时钟模块为系统提供基准频率，所述系统频率相位调整模块实现对系统频率相位的调整，所述本地时钟信号产生模块产生时间信号，为系统和下游设置提供准确的时间。该技术可在满足传统E1频率同步功能的同时实现相位同步，从而实现时间的同步。