本发明公开了一种商品猪安全生产系统及其建立方法，所述商品猪安全生产系统包括若干猪舍、有机肥发酵大棚和蔬菜大棚，若干所述猪舍、有机肥发酵大棚和蔬菜大棚错位设置，所述商品猪安全生产系统包括外围缓冲区、外墙防疫沟、中草药种植区、场/舍入口消毒系统、进出气口钢丝纱网、智能喷雾消毒、单间式猪舍以及超高温发酵八级安全屏障，将猪舍与其他动物和病原最大程度的隔离开；猪舍产生的粪便经过初步发酵和超高温堆肥技术，生成有机肥供蔬菜大棚内种植的蔬菜和场区中草药使用；本发明不仅能够提高猪舍的质量环境，保证生猪的养殖效率，减少粪污对环境的污染，还能变废为宝，有效降低蔬菜和中草药的种植成本，保证蔬菜的原生态健康种植。