本发明公开了一种水肥一体化喷灌系统，该系统中的供水装置与过滤装置连通，并设置有第一增压泵，过滤装置连通施料箱，过滤装置的内部设置有过滤层；搅拌箱连通粉碎装置的顶部，搅拌装置内设置有搅拌叶，在第一电机的驱动下，搅拌叶将加入的肥料搅拌均匀，粉碎装置的内部设置安装有第一齿轮轴和第二齿轮轴，第二电机驱动第一齿轮轴转动，进而带动第二齿轮轴的转动，相向交错的第一凸棱和第二凸棱将肥料进一步粉碎，第一齿轮轴和第二齿轮轴的下方所设置的过滤网将粉碎后块状较大的肥料拦截；施料箱的底部依次连通过滤器、第二增压泵、第一阀门、喷管和第二阀门，开启第二增压泵，施料箱内的物料得以经喷管排出至作物的根系部位。