本发明公开了一种抗菌抗静电阻燃聚酯树脂的制备方法，是将羧基化氧化石墨烯与具有抗菌作用的金属氧化物前驱体进行螯合，再与烷基次膦酸金属盐进行原位聚合，即得所述抗菌抗静电阻燃聚酯树脂；本发明还公开了上述抗菌抗静电阻燃聚酯树脂的应用，它用于制备抗菌抗静电阻燃聚酯纤维。本发明利用羧基化的氧化石墨烯作为载体及协效阻燃部分，与烷基次膦酸金属盐通过原位聚合生成抗菌抗静电阻燃聚酯树脂，并进一步制成抗菌抗静电阻燃聚酯纤维。本发明属于抗菌抗静电阻燃材料制备技术领域，用于制备抗菌抗静电阻燃聚酯树脂，所得树脂进一步地应用于制备相应的纤维。