本发明公开了一种基于智能一卡通的物资管理系统，包括：IC卡、人员身份识别模块、IC卡读写器、后台管理系统；所述IC卡作为纸质凭据的代替品，储存有物资入库任务及物资领用任务及已审批未领用物资信息；所述IC卡读写器用于向所述IC卡内录入物资入库任务或物资领用任务；所述人员身份识别模块用于识别操作人员的身份信息；所述后台管理系统用于记录物资入库、物资出库过程中各个操作环节的事件。由此，本发明的基于智能一卡通的物资管理系统用IC卡代替了纸质凭证，用身份识别技术取代了人工签字，使得物资出入库流程更通畅，各项记录更容易查阅核对。