本发明公开了一种双堆叠结构1553B总线隔离变压器，包括：变压器线圈Ⅰ、变压器线圈Ⅱ和外壳；其中，外壳上设置有两组导引孔组：导引孔组Ⅰ和导引孔组Ⅱ；其中，每组导引孔组包括八个导引孔；变压器线圈Ⅰ和变压器线圈Ⅱ错位设置在外壳内；其中，变压器线圈Ⅰ通过八个引出杆Ⅰ与导引孔组Ⅰ的八个导引孔对接，变压器线圈Ⅱ通过八个引出杆Ⅱ与导引孔组Ⅱ的八个导引孔对接，变压器线圈Ⅰ和变压器线圈Ⅱ相互独立、且电气绝缘；变压器线圈Ⅰ和变压器线圈Ⅱ与外壳内腔之间的空隙内填充有环氧胶。本发明解决了现有1553B总线系统中两路总线使用2只相同型号的隔离变压器，占用印制板布板空间较大的问题。