本发明涉及一种可变频率变压器的转矩和功率波动抑制方法，包括：S1：相关信号采集；S2：将相关信号进行处理，得到定子侧电网正序电压直流分量，定子电压、电流各直流分量；S3：按照预设电压控制方程进行处理，得到串联三相变换器各电压参考值直流分量；S4：进行坐标变换处理，得到串联三相变换器各电压参考值，然后将串联三相变换器各电压参考值相加，得到在两相静止坐标系下串联三相变换器电压参考值；S5：将串联三相变换器电压参考值经过空间矢量调制，得到串联三相变换器开关的控制信号，并将其输入控制器，实现可变频率变压器的转矩和功率波动的抑制。本发明使可变频率变压器具备在双边不平衡且谐波电网电压下运行的能力。