本发明公开了一种从甜菊糖母液中提取莱包迪苷D和莱包迪苷M的方法，其是将甜菊糖母液上样到含有固相吸附材料的色谱分离柱中，用洗脱液洗脱，收集洗脱液，将洗脱液合并，蒸发结晶，即得莱包迪苷D和莱包迪苷M的混合物；其中，所述的固相吸附材料是以苯乙烯-二乙烯苯共聚物为骨架结构；所述的固相吸附材料的粒径为5～30μm，比较面积为400～1000m2/g，孔径为80～1000A，孔容为0.6～1.2cm3/g。该方法工艺过程简单，分离效率高、工艺废液低。所得莱包迪苷D和莱包迪苷M产品纯度在95％以上。