一种水下全密封装置的密封检测系统及检测方法，密封检测系统具有压力舱（1），与所述压力舱（1）连接的观察口（2）、过线机构（3）、排水阀（4）、泄压阀（17）、供气系统和供水系统；检测过程包括以下步骤：将被检水下全密封装置（18）放入压力舱（1）中；将过线机构（3）封闭，启动供气系统向压力舱（1）内充入气体；当压力舱（1）内的气体达到设定的压力后，保压到设定时间后，关闭供气加压装置（12）；启动供水系统将水注入压力舱（1），置换出压力舱（1）内的压缩气体；打开泄压阀（17），使压力舱（1）泄压；观察压力舱（1）内的水面是否出现连续性气泡；当水面出现连续性气泡，则密封性能不符合要求；没有气泡溢出时密封性能符合要求。